Profilage des mutations somatiques dans les sarcomes à haut risque et à faible risque

Les sarcomes des tissus mous sont des tumeurs mésenchymateuses rares dont l'évolution clinique est hétérogène. Les myxofibrosarcomes font partie des STS les plus courants et se manifestent au niveau des extrémités chez les personnes âgées. Ces tumeurs sont principalement traitées par chirurgie en raison de leur faible réponse à la radiothérapie ou aux traitements systémiques. En raison de leur nature hautement infiltrative, les myxofibrosarcomes présentent le taux d'amputation le plus élevé parmi les sarcomes des tissus mous, ce qui affecte négativement la qualité de vie des patients. Même les patients atteints de tumeurs de bas grade doivent être étroitement surveillés, car les tumeurs peuvent récidiver localement, à plusieurs reprises, et souvent augmenter de grade lors de la récidive. À l'autre extrémité du spectre, les myxofibrosarcomes de haut grade métastasent dans 30 à 40 % des cas et ces lésions répondent rarement à la chimiothérapie. Il n'existe actuellement aucun biomarqueur moléculaire ou clinique permettant de prédire de manière fiable quelles tumeurs récidiveront localement ou métastaseront, ce qui conduit de nombreux patients à être surtraités avec des amputations invalidantes, ou sous-traités sans traitement systémique jusqu'à ce que les métastases soient déjà établies et plus difficiles à gérer. Par conséquent, le taux de survie de cette population de patients n'a pas changé au cours des 20 dernières années (68 à 70 % à cinq ans). Les myxofibrosarcomes sont des tumeurs génétiquement complexes, pour lesquelles aucune mutation récurrente exploitable n'a été découverte. Cependant, des études récentes de profilage moléculaire menées sur des cohortes plus importantes de tumeurs ont montré que le myxofibrosarcome comprend trois sous-groupes de méthylation différents, avec des résultats cliniques, une infiltration immunitaire et un profil mutationnel différents. Le profilage moléculaire intégré à des biomarqueurs cliniques ou histologiques a amélioré la stratification des patients dans plusieurs pathologies humaines. Cependant, cela n'a pas été tenté pour ce type de sarcomes. Notre cohorte du ministère de la Santé représente une occasion unique d'étudier ce type de cancer rare à très haute résolution. Une seule étude a déjà tenté le séquençage du génome complet de ce type de tumeur et n'a analysé que cinq échantillons. En raison de la rareté des tissus disponibles dans les grandes biobanques, le séquençage du génome complet de ce type de tumeur a pris du retard par rapport aux cancers plus courants.  Avec le soutien du MOHCCN, nous avons collecté et séquencerons trente cas : la plus grande cohorte pour ce type de tumeur. Il est important de noter que l'annotation clinique de notre cohorte nous permettra de corréler les caractéristiques moléculaires et les résultats cliniques et de développer potentiellement de nouveaux biomarqueurs pour distinguer les patients à haut risque de ceux à faible risque.