Caractérisation du paysage moléculaire et clinique du cancer colorectal mutant BRAF : vers l'identification de nouvelles vulnérabilités thérapeutiques

DNA test inforgraphic

Le BRAF est un oncogène courant dans le cancer et, bien que les technologies actuelles aient permis de mettre au point des traitements efficaces pour certaines mutations du BRAF, une grande partie des tumeurs présentant ces mutations ne répondent toujours pas au traitement. Dix pour cent des cancers colorectaux présentent une mutation du BRAF et sont souvent associés à de mauvais résultats par rapport aux cancers colorectaux sans mutation du BRAF. Nos recherches préliminaires montrent des différences dans le paysage mutationnel et les profils d'expression génétique entre les cancers colorectaux présentant une mutation V600 du gène BRAF et les tumeurs non mutées V600, qui sont moins bien caractérisées. Il existe actuellement des traitements ciblés pour les cancers colorectaux présentant une mutation BRAF V600, mais aucun traitement ciblé n'a été mis au point pour les cancers colorectaux présentant des mutations BRAF non V600.

Ce projet de science des données examine les points communs et les différences entre ces sous-types de cancers colorectaux en relation avec la résistance acquise ou intrinsèque aux traitements. Nous utiliserons des méthodes de séquençage d'ARN en vrac à partir d'ensembles de données publiques sur les tumeurs colorectales et sur des tumeurs dérivées de patients développées chez des souris dans le cadre de l'essai BEAVER. À l'aide d'échantillons de tissus tumoraux colorectaux provenant d'une autre cohorte, nous validerons les résultats des analyses de séquençage d'ARN et étudierons les populations cellulaires au sein de ces tumeurs à l'aide de technologies d'immunofluorescence multiplexe. Cette vaste cohorte de tumeurs colorectales mutées V600 et non V600 BRAF nous permettra de découvrir des biomarqueurs potentiels de la réponse au traitement afin de personnaliser les soins prodigués aux patients. Cela pourrait améliorer considérablement l'efficacité des traitements administrés aux patients atteints de cancers colorectaux mutés BRAF qui sont résistants aux thérapies ciblées standard.

Citations

« J'ai toujours été motivée par la recherche sur le cancer en raison de mon expérience personnelle avec des membres de ma famille touchés par cette maladie. Être reconnue pour mon travail acharné et recevoir ce prix signifie beaucoup pour moi, car cela me permettra de mener mes recherches vers de nouveaux sommets. Je suis extrêmement enthousiaste à l'idée de poursuivre ces recherches avec le soutien du Marathon de l'espoir et de l'Équipe Canada de la recherche sur le cancer afin d'améliorer la vie des patients atteints de cancer. » – Emmanuelle Rousselle, lauréate du Bourse pour informatique de la santé & science des données

« Les cancers colorectaux métastatiques présentent souvent des mutations BRAF, ce qui les rend très agressifs et difficiles à traiter. Alors qu'il existe des traitements pour les mutations V600 BRAF, les mutations non V600 BRAF, plus fréquentes chez les patients jeunes atteints d'un cancer colorectal précoce, ne bénéficient pas de thérapies ciblées. Le projet d'Emma explorera les caractéristiques uniques des cancers colorectaux mutants BRAF au niveau de l'ADN, de l'ARN et des protéines. Elle espère découvrir de nouvelles vulnérabilités thérapeutiques afin d'améliorer les résultats des traitements pour les patients atteints de ces cancers difficiles à traiter. » – Drs Gerald Batist et April Rose, mentors